วันที่ 8 มีนาคม 2509 สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง พร้อมด้วย สมเด็จพระเจ้าน้องนางเธอเจ้าฟ้าจุฬาภรณวลัยลักษณ์ อัครราชกุมารี กรมพระศรีสวางควัฒน วรขัตติยราชนารี ทั้งสองพระองค์เสด็จฯทางชลมารคโดยเรือพระที่นั่ง "เศษกระดาน" เลียบตามฝั่งแม่น้ำเจ้าพระยามาถึง ตำบลบางปูใหม่ บริเวณหมู่บ้านคลองคอต่อ ทอดพระเนตรเห็นเรือประมง แล่นเข้าคลอง จึงเสด็จฯ ตามเรือประมงไปจนสุดคลองซึ่งไปสิ้นสุดที่ถนนสุขุมวิท (สายเก่า) ริมฝั่งคลอง ทั้งสองข้างมีหมู่บ้านของชาวประมงอาศัยอยู่ ชาวบ้านส่วนใหญ่ มีฐานะยากจน เมื่อชาวบ้านทราบว่า สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง เสด็จ ฯ มา ก็พากันไปเฝ้าฯ และทูลเกล้า ฯ ถวายสิ่งของตามแต่ ที่จะหามาได้ เช่น กุ้ง ปู ปลา หอย เป็นต้น สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง มีพระราชเสาวนีย์ถาม ชาวบ้านถึงเรื่องวัดศรีจันทร์ประดิษฐ์ และโรงเรียนในหมู่บ้านนี้ ชาวบ้านจึงกราบบังคมทูลขอให้ทรงสร้าง โรงเรียนมัธยมศึกษาขึ้น ในหมู่บ้านเพราะมีแต่โรงเรียนประถมศึกษา สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง มีพระราชเสาวนีย์ว่า จะนําความกราบบังคมทูล พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร เพื่อขอพระราชทานให้จัดสร้างโรงเรียนมัธยมศึกษาเพื่อสงเคราะห์เด็กขัดสนขึ้น ณ ตำบลนี้
หลังจากนั้นพระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร ทรงพระกรุณาโปรดเกล้า ฯ ให้นายวิเชียร วชิรพาหุ ซึ่งดำรงตำแหน่ง รองอธิบดีกรมการศาสนา มาดำเนินการสืบหาเรื่องที่ดินของวัดศรีจันทร์ประดิษฐ์ และบริเวณใกล้เคียง เมื่อทรงทราบว่าวัดศรีจันทร์ประดิษฐ์เป็นวัดมหานิกายสายสมเด็จพระสังฆราช จึงทรงพระกรุณาโปรดเกล้า ฯ แต่งตั้งคณะกรรมการจัดสร้างโรงเรียนขึ้นคณะหนึ่ง โดยมีคณะกรรมการ ประกอบด้วย
1.สมเด็จพระอริยวงศาคตญาณ (ปุ่น ปุณณสิริมหาเถร) เป็นประธานกรรมการและเจ้าของโรงเรียน
2.นายสัญญา ธรรมศักดิ์ ประธานองคมนตรี
3.พลเรือเอกหม่อมเจ้ากาฬวรรณดิศ ดิศกุล
4.ดร. กัลย์ อิศรเสนา ณ อยุธยา
5.นายจํานง ราชกิจ
6.พลอากาศตรีศึกชัย สุวรรณเนตร
7.นายวิเชียร วชิรพาหุ
ต่อมาเมื่อนายจํานง ราชกิจ ถึงแก่กรรม จึงทรงพระกรุณาโปรดเกล้าฯ ให้นายภาวาส บุนนาค เป็นกรรมการแทน เมื่อปลายปี พ.ศ. 2511 พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตรพระราชทานทุนทรัพย์ส่วนพระองค์เป็นทุนเริ่มแรก จำนวน 400,000 บาท (สี่แสนบาทถ้วน) สำนักงานสลากกินแบ่งรัฐบาลบริจาคเพิ่มเติม 400,000 บาท (สี่แสนบาทถ้วน) บริษัท สังกะสีไทย จํากัด จังหวัดสมุทรปราการ บริจาคเพิ่มเติม จำนวน 400,000 บาท (สี่แสนบาทถ้วน) ข้าราชการ พ่อค้า ประชาชน บริจาคเพิ่มเติม จำนวน 100,000 บาท (หนึ่งแสน บาทถ้วน) ผู้มีจิตศรัทธาน้อมเกล้าฯ ถวายที่ดินประมาณ 10 ไร่เศษ เพื่อใช้ในการก่อตั้งโรงเรียนมัธยมวัดศรี จันทร์ประดิษฐ์ และมีการก่อสร้างอาคารเรียนหลังแรก คืออาคาร “ภ.ป.ร.”
เมื่อปี พ.ศ. 2512 พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร และสมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง เสด็จพระราชดำเนินไปทรงวางศิลาฤกษ์อาคารเรียน เมื่อวันที่ 12 มิถุนายน พ.ศ. 2512 ซึ่งเป็นอาคารเรียน หลังแรกเป็นตึกทรงไทย 2 ชั้น ชื่ออาคาร “ภ.ป.ร.” ขนาด 8 ห้องเรียน ราคา 1,300,000 (หนึ่งล้านสามแสนบาทถ้วน) เปิดทำการสอนครั้งแรกเมื่อปี พ.ศ. 2513 ระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 5 ถึงมัธยมศึกษาปีที่ 1 ในปีการศึกษา 2514 เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 5-6 ชั้นมัธยมศึกษาปีที่ 1-2 และปีการศึกษา 2515 เปิดทำการสอนชั้นประถมศึกษาปีที่ 5-7 และมัธยมศึกษาปีที่ 1-3 เป็นต้นมา
ต่อมาเมื่อวันที่ 3 กันยายน พ.ศ. 2516 สมเด็จพระสังฆราชสกลมหาสังฆปรินายก ประธานกรรมการ และเจ้าของโรงเรียนพร้อมด้วยคณะกรรมการจัดสร้างโรงเรียนมัธยมวัดศรีจันทร์ประดิษฐ์ คณะกรรมการ บริหาร ได้มาประชุมเพื่อปรึกษาหารือเกี่ยวกับการ ดำเนินการจัดสร้างอาคารเรียนหลังที่ 2 การมาประชุมครั้งนี้ สมเด็จพระสังฆราชสกลมหาสังฆปรินายกทรงพระประชวนอย่างกะทันหัน จึงมอบให้ นายสัญญา ธรรมศักดิ์ เป็นประธานการประชุมต่อไป หลังจากเสด็จ ฯ กลับมาแล้ว ก็ทรงประชวนประทับอยู่ ณ โรงพญาบาลจุฬาลงกรณ์ และสิ้นพระชนม์ เมื่อวันที่ 7 ธันวาคม พ.ศ. 2516 หลังจากสมเด็จพระสังฆราชสกลมหาสังฆปรินายกสิ้นพระชนม์ พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร ทรงพระกรุณาโปรดเกล้า ฯ แต่งตั้ง ฯ พณ ฯ ดร. กัลย์ อิศรเสนา ณ อยุธยา เป็นเจ้าของโรงเรียน
เมื่อปี พ.ศ. 2518 พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศร มหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราช บรมนาถบพิตร สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์ พระบรมราชินีนาถ พระบรมราชชนนีพันปีหลวง และสมเด็จพระเจ้าน้องนางเธอเจ้าฟ้าจุฬาภรณวลัยลักษณ์ อัครราชกุมารี กรมพระศรีสวางควัฒน วรขัตติยราชนารี เสด็จพระราชดำเนินไปทรงเยี่ยมชมโรงเรียน และทรงเจิมแผ่นศิลาฤกษ์ที่ประดิษฐาน ณ อาคาร ภ.ป.ร. เมื่อวันที่ 2 กรกฎาคม พ.ศ. 2518
(ที่มา เทศบาลตำบลบางปู)